I primi indici si trovano alla fine del tomo 25.

Catalogi duo ad collectionem Muratorianam Scriptorum rerum italicarum cum accessionibus I.M. Tartinii et I.B. Mittarelli, quorum primus Scriptorum omnium ordine alphabetico, alter eorundem per loco et regiones digestus, in Giovanni Poleni, Catalogi quatuor, quorum duo ad Gronovii, Graevii, Sallengre, Poleni, et Burmanni Thesauros antiquitatum graecarum, romanarum et italicarum; duo ad collectionem Scriptorum rerum italicarum Muratorii, Tartinii, et Mittarelli, Bononiae, Ex Officina Guidi sub signo anchorae, 1853, pp. 91-160.

Carlo Cipolla, Antonio Manno, Indices chronologici ad Scriptores rerum italicarum quos Ludovicus Antonius Muratorius collegit, “Miscellanea di storia italiana” , XXIV (serie II, vol. IX),  Torino, 1885, XVI, 187 p., ried. Hildesheim; New York; Georg Olms verlag, 1977.